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Proteus精简版6、7与简体中文版文件，详尽安裝看使用说明书。有协助文件与Tools文件夹
ISIS应用了以下的文件种类
设计文件（Design Files）
一部分文件（Section Files）
控制模块文件（Module Files）
库文件（Library Files）
设计包括一个电源电路的全部信息内容，文件拓展名叫ldquo;DSN。ISIS之前的版本号曾使用过的后缀名有ldquo;ISS，ldquo;IDS，ldquo;IIWS，假如在文件目录PROTEUS下安裝了文件转化器IDSCVT40.DLL和(或)IWSCVT40.DLL,这种后缀名的文件就可以全自动变换回来。
一部分的电路原理图可以倒出为一部分文件，随后可以读取到其他文件。后缀名是SEC。可以用文件（File）菜单栏中的ldquo;导进(Import)和ldquo;导出来(Export)指令来跟读和写。
控制模块文件的后缀名是ldquo;MOD，可以和其余的功能一起应用来完成层级设计。更具体的状况参考ldquo;层级设计( HIERARCHICAL DESIGNS )。
标记和器件的库文件的后缀名是ldquo;LIB。
Proteus VSM模拟仿真系统软件还可以应用其他的文件种类。详尽信息请参考VSM使用手册。
逐渐一个新的设计（Starting a New Design）
指令ldquo;New Design将消除全部原来的设计数据信息，发生一张空的A4纸。新设计的默认设置名称为UNTITLED.DSN，ldquo;Save Design指令会把设计以这一名称存进硬盘文件中，文件的别的选择项也会应用它做为默认设置名。